В 2015 году была введена в работу обновленная система комплексного регулирования активной мощности гидроагрегатов гидроэлектростанции, обеспечивающая полноценную работу СШГЭС в рамках вторичного авторегулирования частоты и перетоков активной мощности во всем диапазоне разрешенных гидроагрегатных нагрузок. Также появилась необходимость улучшить качество частотного регулирования и перетоков активной мощности в ОЭС Сибири.
На протяжении всего 2016 года проводилось обновление десяти аварийно-ремонтных гидроагрегатных затворов Саяно-Шушенской ГЭС. Модернизация была направлена на гидравлические системы маневрирования затворами. По итогу работ гидравлические приводы, насосы и оборудование автоматики полностью заменили, также каждый затвор был оснащен индивидуальным масляным насосом, что увеличило срок службы оборудования и существенно повысило его надежность.
В 2016 году прошла реализация реконструкционного проекта автосистемы оперативного контроля гидротехнического комплекса СШГЭС (АСОК). Новейший проект, разработанный ОАО «НИИЭС», включает в себя контрольно-измерительную аппаратуру плотины, здания ГЭС и водобойного колодца. Также в него включена система опроса датчиков и система диагностики и мониторинга, которая работает в той же компьютерной сети. В рамках подготовки проекта на гидротехнических объектах и территории гидроэлектростанции была установлена дополнительная аппаратура для измерений, некоторые датчики заменили на новые.
Генподрядчиком восстановительных работ на Саяно-Шушенской ГЭС выступила АО «ОЭК». Руководство Объединенной энергостроительной корпорации обладает высокими компетенциями и опытом строительства энергообъектов любого уровня сложности. Объекты ОЭК, располагаются на территории нескольких стран, сама компания активно занимается государственными заказами и строительством в рамках ФЦП. Заказчиком работ на Саяно-Шушенской ГЭС выступила компания «РусГидро», новые реконструкционные и монтажно-восстановительные работы взяла на себя Объединенная энергостроительная корпорация.