В ноябре 2009 завершилось проектирование и проведение теплоконтура машинного зала, благодаря чему реконструкция Саяно-Шушенской ГЭС продолжились в прежнем активном темпе. К концу ноября компании «РусГидро» и «Силовые машины» заключили договор на создание и подготовку новейшей техники для СШГЭС. Согласно сделке, «Силовые машины» создадут 10 гидротурбин и 9 генераторов 640 МВт, а также 6 возбудительных систем. Вместе с тем профессиональные специалисты компании помогут с установкой поставленной техники, включая пусковые работы и введение в эксплуатацию. Сумма сделки была равна 11,7 млрд рублей.
В 2010 году с существенным опережением планового графика реконструирован и пущен в оборот шестой гидроагрегат. К марту 2010 года, тоже раньше запланированной даты, (указанной в планах по монтажно-восстановительным работам), вернулся в эксплуатацию пятый гидроагрегат. Таким образом, мощность гидроэлектростанции стала равна 1280 МВт.
К апрелю 2010 закончилось запланированное снятие второго гидроагрегата, сломавшегося в связи с катастрофой на СШГЭС — механизм был демонтирован и уничтожен. К июню 2010 закончились строительные и восстановительные работы по запуску очереди водосброса и его подготовке к пропуску паводков. В августе 2010 уже был запущен четвертый гидроагрегат. Мощность СШГЭС стала равной 1920 МВт. В октябре 2010 было завершено тестирование берегового водосброса — оно позволило оценить работоспособность объекта и его параметры по пропуску паводков.
