В 2012 году первый гидроагрегат Майнской ГЭС был выведен в реконструкцию. К 2013 году началась сборка силового оборудования в помещении КРУЭ-220 Майнской ГЭС, а в рамках проекта реконструкции автоматизированной системы оперативного контроля ГТС СШГЭС начались работы по монтажу оборудования. На Саяно-Шушенской ГЭС также был обновлен сейсмометрический комплекс. В 2014 году была проведена реконструкция механизма разворота лопастей рабочего колеса гидроагрегатов Майнской ГЭС. Параллельно там же начались испытания гидроагрегата №1. Была завершена комплексная реконструкция открытого распределительного устройства (ОРУ-220 кВ) Майнской ГЭС с переходом на КРУЭ-220 кВ (комплектное элегазовое распределительное устройство закрытого типа напряжением 220кВ). В рамках модернизации системы АСУ ТП Центральный пульт управления Саяно-Шушенской ГЭС впервые в истории российской гидроэнергетики оборудовали видеостеной.
В 2015 году на Саяно-Шушенской ГЭС при участии «ФСК ЕЭС» проведено обновление автосистемы предотвращения нарушения устойчивости, которая предотвращала нарушения в устойчивой работе энергосистемы Сибири. После введения в работу второй цепи линии электропередачи «Абаканская-Итатская», объединяющей энергосистемы Хакасии и Красноярского края, оператор ОЭС Сибири выдал гидроэлектростанции разрешение на деятельность с мощностью до 5100 мегаватт. В результате «запертая» мощность СШГЭС уменьшилась на 700 мегаватт.
